SMP Negeri 3 Mojokerto terletak di Jalan Raya Cinde No. 2, Kecamatan Prajurit Kulon, Kota Mojokerto. Sebelah timur berbatasan dengan perkantoran diantaran kantor Kecamatan Prajurit Kulon, Kantor Polsek, Perpustakaan kota,  sebelah selatan berbatasan dengan lapangan Surodinawan, sebelah barat berbatasan dengan Puskesmas Blooto, sebelah utara berbatasan dengan jalan raya dan area pemukiman warga. 

Kondisi lahan sangat memadai dengan luas tanah 9,069 M², lahan yang sebelumnya area persawahan memiliki tanah yang subur sehingga tumbuhan dengan mudah tumbuh yang menjadikan suasana asri dan nyaman. Kesuburan tanah yang dimiliki SMP Negeri 3 Mojokerto juga dimanfaatkan untuk membudidayakan tanaman obak keluarga. Tanaman obat keluarga tersebut selanjutnya diolah menjadi minuman herbal dan permen yang diberi nama “Jurus 311”. Proses penanaman hingga pengolahan menjadi produk pangan tersebut tersebut terinclude dalam kegiatan projek sekolah.